Koga Takuza, fondateur du Foot Clan
Le Foot Clan est né plus de 1500 ans dans le passé, fondé par Koga Takuza, l’un des plus grands ninjas du Japon. Il maniait le sabre comme aucun samurai et a fait tomber guerriers et chefs de clans. Il dérobait à ses rivaux vaincus des trophées, qu’il fusionna en un alliage plus solide que l’acier ; ainsi naquit le kuro kabuto porté par Shredder dans la série.
Durant le XXe siècle, le Foot Clan livrait bataille au Hamato Clan. Au cours de l’un des affrontements les plus violents, Hamato Yūta, chef de son clan, recueillit Oroku Saki, fils du chef rival tombé au combat. Encore qu’un enfant innocent, l’homme préféra le recueillir avant de mettre un terme aux agissements du clan millénaire. Saki se fit élevé au sein du clan Hamato, avec Hamato Yoshi, fils du chef du clan. Ses origines lui avaient été cachées. Ainsi, Oroku Saki apprit la vérité sur ses origines une fois devenu adulte. Il décida de reformer le Foot Clan et d’écraser ceux qui avaient tué son père (La légende des yokai, S3 E20).
Depuis ce jour, le Foot Clan était dirigé par Oroku Saki, qui prit l’identité de Shredder. Il portait fièrement sur sa tête le kabuto de Takuza, pour qui il donnerait sa vie. Opérant tout d’abord au Japon, il partit pour New York lorsqu’il apprit que son vieux rival, Hamato Yoshi était encore en vie (L’apparition des tortues, part. 2, S1 E2).
Au cours de sa lutte contre Yoshi et ses disciples, Shredder essaya de former une alliance osée avec les kraangs (Le retour du Pulvériseur, S1 E22). S’il ne voyait aucun intérêt dans ces extraterrestres de prime abord, il se rendit compte qu’ils pouvaient lui apporter un avantage indéniable. Il leur livra April, longuement convoitée. Ainsi, il pourrait attirer Yoshi à lui et le tuer. Il fut surpris de découvrir que son vieux rival était devenu un rat mutant (L’affrontement, S1 E25-26). 
Après le départ de Shredder pour la Japon au début de la saison 2, c’est Karai qui mena le clan. Les envahisseurs fournissaient alors au clan des footbots, robots ninjas améliorés. Malgré les ordres stricts de son « père », l’adolescente poursuivit les échanges avec les kraangs et se fit trahir (Une cible nommée April O’Neil, S2 E6). Si l’alliance semblait définitivement brisée Shredder parvint à négocier un nouveau compromis afin d’obtenir une petite part de la ville lors de la nouvelle invasion extraterrestre (L’invasion, S2 E25).
Lors d’une troisième tentative d’invasion de la part des kraangs, Splinter vint trouver Shredder et lui demander de l’aide. Un autre ennemi attaquait depuis l’espace, les triceratons. La Terre était en grand danger. L’homme accepta à contrecœur et lors de l’attaque, essaya de tuer son vieux rival. Leonardo, qui avait déjà vécu ce moment (L’anéantissement de la Terre, part. 2, S3 E26), avertit son père, qui put éviter le pire et blesser grièvement Shredder (Ultime chance pour la Terre, S4 E14). Tiger Claw le recueillit et lui prodigua des soins avec l’aide de Baxter Stockman à partir d’un mutagène amélioré. La recette n’était pas optimale et Saki voulut se faire inoculer tout ce que le scientifique possédait pour être sur pieds au plus vite. En effet, Karai et Shinigami dévastaient les possessions du Foot Clan pour le ruiner et faire renaître de ses cendres (La guerre des clans, S4 E15).
Ainsi, Shredder devint un mutant terriblement dangereux. Il s’attaqua à Splinter, qu’il manqua de tuer une première fois (Super Shredder, S4 E20). Toutefois, son état demeurait terriblement instable jusqu’à ce que Stockman parvienne à parfaire sa recette. Une fois stabilisé, Super Shredder partit au combat avec ses sentiments désinhibés. Il tua Splinter après avoir manqué Karai (Requiem, S4 E25). Les tortues partirent lui livrer bataille dans son domaine et Leonardo le décapita (La fin, S4 E26).
La mort de Shredder devait signifier la fin d’un Foot Clan violent à travers sa nouvelle cheffe, Karai. Toutefois, Tiger Claw désirait ramener Shredder à la vie et engagea pour cela un démon du nom de Kavaxas. Ils devaient réunir le kuro kabuto et le cœur de Shredder, tous deux arrachés à son cadavre.
Parallèlement, Hattori Tatsu, chargé de la formation des recrues de la branche japonaise du clan, revendiquait la tête du Foot Clan. Karai et les tortues essayèrent de le maîtriser ; il fut tué par Kavaxas. Le cœur de Shredder quant à lui était en possession de don Vizioso, qui désirait le manger pour en acquérir la force. L’organe fut retrouvé par le démon, pouvant ainsi faire revenir Shredder à la vie.
La créature morte-vivante qui apparut était secrètement aux ordres de Kavaxas et renversa Tiger Claw pour délivrer le démon de ses ordres. Ce dernier ouvrit une brèche entre le monde des morts et celui des vivants. Les tortues réussirent à renvoyer Kavaxas de là où il venait, avec Shredder, grâce à Michelangelo. Dès ce jour, le Foot Clan appartint définitivement à Karai (La fin des temps, S5 E4).
Composition du clan
- Oroku Saki / Shredder (chef du clan)
- Tiger Claw (second de Shredder à partir de Tremblement de ver, S2 E13)
- Bradford (en charge de la formation des jeunes recrues dans son dojo avant sa mutation)
- Fishface (Homme de main de Shredder, partenaire occasionnel de Bradford et ses diverses mutations et chargé du lien entre les gangs des rues comme les Purple Dragons)
- Baxter Stockman (Scientifique et homme de main de Shredder)
- Ivan Steranko / Rocksteady (Homme de main de Shredder)
- Anton Zeck / Bebop (Homme de main de Shredder)
- Soldats Foot (Fantassins)
- Foot humains (première saison)
- Footbots (seconde saison – de conception kraang)
- Footbots d’élite (garde d’élite)
- Chrome Dome (seconde saison – Fréquemment détruit, de conception kraang)
Alliés du Foot Clan
- Les kraangs (occasionnellement, saison 1 à 3)
- Ivan Steranko (avant de rejoindre définitivement Shredder en saison 3)
Anciens membres ou alliés du Foot Clan
- Timothy (chair à canon du clan, avant de devenir Mutagen-Man, Le retour du Pulvériseur, S1 E22)
- Karai (second de Shredder avant d’être remplacée par Tiger Claw). Elle tente de quitter le Foot Clan en apprenant que son vrai père était Hamato Yoshi, et non Shredder.
